İç İçiçe ve İnce Dengeli: Endoplazmik Retikulum Morfolojisi, Dinamiği, İşlevi ve Hastalıkları Bölüm 7

3.4. ER Dinamiğinin Hesaplamalı Analizi

ER'nin dinamiklerini in vivo olarak analiz etmek, karmaşık morfolojisi ve hızlı dinamiklerinin yanı sıra floresan mikroskopi deneylerinin fototoksisitesi nedeniyle zordur. Ağın matematiksel modellemesi, bu karmaşık sisteme farklı bir bakış açısıyla daha fazla bakış açısı kazandırmak için bir fırsattır.

Karmaşık formlar etkileme ve hatta büyük ilgi uyandırma eğilimindedir. Ancak bu grafiklerin, metinlerin veya diğer formların hatırlanmasının kolay olup olmadığı araştırmaya değer bir sorudur.

Genel olarak konuşursak, karmaşık şekillerin hatırlanması daha fazla hafıza gerektirir. Örneğin karmaşık bir matematik formülü, karmaşık bir kalıp ya da karmaşık bir şifreyi hatırlamak için daha fazla zaman ve çaba harcamamız gerekir. Ancak bu, karmaşık şekillerin hatırlanmasının zor olacağı anlamına gelmez.

Tam tersine, karmaşık formlarla aktif olarak yüzleşirsek ve doğru hafıza yöntemini benimsersek, bunları kolaylıkla hatırlayabiliriz. Örneğin, karmaşık bir formülü ezberlemek istediğimizde "adım adım hafıza" yöntemini kullanabiliriz, yani önce formülü daha küçük birimlere ayrıştırır, her birimi ezberler ve son olarak bu birimleri birbirine bağlarız.

Ayrıca karmaşık biçimleri hatırlamamıza yardımcı olması için çeşitli hafıza tekniklerini kullanabiliriz. Örneğin şekli zaten aşina olduğumuz şeylerle ilişkilendirmek için çağrışımlar oluşturmak hafızayı güçlendirir. Veya şekilleri resimlere dönüştürmek için görüntü anımsatıcılarını kullanabiliriz, bu da hatırlamayı kolaylaştırır.

Kısacası karmaşık şekiller hatırlanmasının zor olduğu anlamına gelmez. Onları doğru şekilde karşıladığımız ve olumlu bir tutum sürdürdüğümüz sürece onları kolaylıkla hatırlayabiliriz. Bu tür çabalar sayesinde yalnızca karmaşık biçimleri daha iyi hatırlamakla kalmıyoruz, aynı zamanda hafızamızı geliştirip kendimizin daha iyi versiyonları haline gelebiliyoruz. Hafızayı geliştirmemiz gerektiği görülebilir ve Cistanche Deserticola hafızayı önemli ölçüde geliştirebilir çünkü Cistanche Deserticola, hafızayı geliştirmek de dahil olmak üzere birçok benzersiz etkiye sahip geleneksel bir Çin tıbbi malzemesidir. Cistanche Deserticola'nın etkinliği, tannik asit, polisakkaritler, flavonoid glikozitler vb. dahil olmak üzere içerdiği çok sayıda aktif bileşenden gelir. Bu bileşenler, çeşitli yollarla beyin sağlığını geliştirebilir.

Belleği geliştirmenin 10 yolunu bilin'e tıklayın

ER tübülleri, çapraz bağlarla temsil edilen bağlantı noktalarına sahip yarı esnek polimerler olarak kabul edilebilir. Son zamanlarda birçok grup, moleküler motorlar gibi aktif kuvvetlerden etkilenenler de dahil olmak üzere, yarı esnek polimerlerin [263-266] bu tür çapraz bağlı ağlarının dinamiklerini modellemiştir [267-270]. Bu tür modeller, sistemi basitleştirerek ve yalnızca mikrotübüllerle etkileşimleri dikkate alarak ER ağ dinamikleri hakkında fikir verebilir.

Yarı esnek polimerlerden oluşan bir ağ tarafından çevrelenen bir parçacığın hareketini modelleyen yeni bir çalışma, ER'nin aktif yeniden düzenlenmesinin işlevsel nedeni hakkında fikir verebilir. Gong ve ark. [270], yarı esnek polimerlerden oluşan bir ağ içine gömülü bir parçacığın difüzyonunun, aktif motorların varlığıyla arttırıldığını buldu.

Aktif motorların olduğu bir ağda parçacıkların difüzyonu süper-yayılırken, aktif motorların olmadığı bir ağda alt-difüzyon gözlendi. Bu artan hareket için verilen olası bir açıklama, aktif motorların varlığında parçacık ile ağ arasındaki çarpışma sayısının daha fazla olmasıydı.

Bu sonuç ER lümenindeki parçacıkların dinamiği ile ilgili olabilir. Ağın tübülleri ve tabakalarındaki dalgalanmalar, lipit çift katmanının lümenal yüzü ile daha sık çarpışmalar nedeniyle lümen içindeki parçacıkların daha hızlı dinamiklerini tetikleyebilir.

Bitki ER morfolojisi ve dinamiğinin belirli yönlerinin, ER'nin mümkün olan minimum tübül uzunluğu kullanılarak noktaların bağlandığı minimal bir ağ [271-273] olarak dikkate alınmasıyla kopyalanabileceği de gösterilmiştir. Bu model, ER morfolojisi ve dinamiğinin bazı yönlerini doğru bir şekilde yeniden oluşturur. Ağın boru şeklindeki bölgelerinin yapısı, halka kapanmasının dinamikleri gibi, doğru bir şekilde yeniden yaratılmıştır.

Ancak bu yaklaşım henüz model kullanılarak bulunan ağın hızlı yeniden düzenleme dinamiklerini deneysel olarak gözlemlenenlerle ilişkilendirememektedir [273]. Lümenal parçacıkların hareketi de yakın zamanda simüle edilmiştir.

Reaksiyon ortaklarını arayan ER lümeni içindeki parçacıkların dinamiklerini tanımlayan bir model, ağın morfolojik özelliklerinin, moleküllerin keşif sürelerini belirleyen en etkili faktörler olduğu sonucuna varmıştır [274].

Görüntüleme verilerinde ve ER ağını temsil etmek için kullanılan modellerde gelecekte yapılacak iyileştirmeler, hem hesaplama modellerinin sonuçlarında hem de deneysel verilerin analizine yönelik iş akışlarında iyileştirmelerle sonuçlanacaktır.

Son zamanlarda birkaç grup, canlı hücrelerdeki acil servis videolarından dinamik değişkenleri çıkarmak için tasarlanmış açık kaynaklı yazılım yayınladı [24,27]. ER ağının morfolojisini ve dinamiklerini ölçmeye yönelik bu tür yöntemler, bu organel hakkındaki anlayışımızı ilerletmek için gereklidir.

Çeşitli hücresel koşullar altında dinamik ve morfolojideki değişiklikleri analiz etmek,ER dinamiklerinin altında yatan nedene ve değişen dinamiklerin klinik patolojilere yol açabileceğine ışık tutacak.

4. Morfoloji, Dinamik ve Hastalık

ER gibi kritik ve çeşitli işlevleri olan bir organelin birçok hastalıkta rol oynaması şaşırtıcı değildir. ER'nin fonksiyonel alt alanlarının morfolojisi ve dağılımındaki düzensizliğin (Bölüm 2.2'de açıklandığı gibi) bu nedenle fonksiyonlarını etkilemesi muhtemeldir ve özellikle nöronlarda hastalık durumlarına yol açabilir [32].

ER morfolojisini düzenleyen birçok proteinin insan hastalıklarında mutasyona uğradığı bilinmektedir [227]. ER ve mitokondri arasındaki yanlış iletişimin, kalsiyum iyonu transferindeki düzensizlik, insülin sinyali veya mitokondriyal bölünme yoluyla birçok hastalığa katkıda bulunan bir faktör olduğu da tespit edilmiştir.

ER ile endozomlar/lizozomlar arasındaki etkileşimler de normal hücresel fonksiyon için benzer şekilde hayati öneme sahiptir; bu etkileşimlerde yer alan proteinler mutasyona uğradığında nöronlarda özel problemler görülür [195,227].

Ek olarak, patojenik enfeksiyonlara yol açan birçok organizma, çoğalmaları veya hücreye girmeleri için ER mekanizmasına güvenir. Hem hastalıklarda hem de ER bakımında rol oynayan en iyi karakterize edilmiş proteinler Tablo 1'de özetlenmiştir.

Pek çok hastalıkta, özellikle de kardiyovasküler hastalıklarda bir diğer önemli faktör ER stresidir. MCS'ler diğer pek çok stres türünden etkilenir [85,275] ve dolayısıyla bunun hastalıkta önemli bir faktör olduğu kanıtlanabilir. ER morfolojisi ile ERstres arasındaki etkileşimi tam olarak araştırmak için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır. Aşırı ER stresi, UPR aktivasyonu ve hastalıkların başlangıcı arasındaki bağlantılar yakın zamanda gözden geçirilmiştir [276-278] ancak burada ele alınmamaktadır.

ER morfolojisini düzenleyen proteinler, çoklu nörodejeneratif bozukluklar da dahil olmak üzere birçok hastalıkta rol oynar (mükemmel, kapsamlı bir inceleme için bkz. [227]). ER tübüllerinin ağa füzyonuna aracılık eden bir protein ailesi olan Atlastinlerin [4,348], kalıtsal spastik paraplejide (HSP) [285] ve kalıtsal duyusal ve otonomik nöropatide (HSAN) [346,347] mutasyona uğradığı bilinmektedir.

ER'de yüksek membran eğriliği bölgelerini stabilize ettiği bilinen REEP'ler ve protrudin [2,281], aynı zamanda bazı HSP formlarında da mutasyona uğramıştır [280,286], bu durum anormal ER morfolojisinin hastalıkta rol oynadığını düşündürmektedir. ER-geç endozom/lizozom MCS'leri nöronlarda sıklıkla görülürler [70] ve hastalığa neden olan mutasyonlardan yaygın olarak etkilendikleri göz önüne alındığında hayati önem taşırlar (Tablo 1; [227]). Protrudin mutasyonları, kinesin-1 ile etkileşimleri ve hareketli ER tübül-geç endozom MCS'lerinin üretilmesindeki rolü nedeniyle aksonlardaki ER dağılımını etkileyebilir [205].
Bu işlev etkili nörit uzantısı için hayati öneme sahiptir [129,195,204,227]. KIF5A'daki mutasyonlar muhtemelen bu yolu etkileyebilir. ER-endozomal etkileşimlerin bozulması aynı zamanda endozomal sıralamayı da etkiler ve lizozomal kusurlara yol açar (Bölüm 2.2.6 ve 3.1.2) ve bu sıklıkla HSP ve ALS (Tablo 1) gibi hastalıklarla bağlantılıdır ve spastindeki mutasyonlardan kaynaklanabilir. , strumpelin, REEP1 [177] ve VAPB, bu özel sayıda başka bir yerde anlatıldığı gibi [291].

ER morfolojisini ve dinamiklerini düzenleyen proteinlerdeki mutasyonlar aynı zamanda amyotrofik lateral skleroz (ALS), Alzheimer hastalığı, Warburg Mikrosendromu ve spinoserebellar ataksi tip 2 ile de ilişkilendirilmiştir.

Retikülon 3 ve 4, sırasıyla Alzheimer hastalığında [336] ve ALS'de [299] mutasyona uğramıştır. Retikülonlar ER membran eğriliğini düzenler [2] ve ALS'deki mutasyonları, ER içindeki şaperon proteinlerinin dağılımını değiştirir [299] ve bu nedenle ER fonksiyonunu olumsuz etkilemesi muhtemeldir. Son zamanlarda Mookherjeeet ark. nörodejeneratif hastalıkların ortak bir özelliği olan sitoplazmadaki protein birikmesinin hem ER morfolojisini hem de dinamiğini etkilediğini keşfetti [359].

Retikülon 4'ün, gözlemlenen anormal ER yapısının nedeni olabilecek sitoplazmik agregatlara bağlandığı bulunmuştur. Protein agregatlarına sahip hücrelerde daha az üç yollu bağlantı, daha yavaş lümen dinamikleri ve bozulmuş tübül füzyon verimliliği gözlendi.

Bu nedenle, yalnızca morfolojiyi düzenleyen proteinler hastalığın başlangıcında rol oynamakla kalmaz, aynı zamanda hastalık ilerledikçe hücresel süreçleri de etkileyebilirler.

Nörogelişimsel kusurlarla sonuçlanan nadir bir hastalık olan Warburg Mikro sendromuna Rab18'deki mutasyonlar neden olabilir [29]. Rab18, NRZ kompleksini ve SNARE proteinlerini içeren ER-lipid damlacık MCS'nin düzenlenmesi [343,360] (fakat her koşulda değil [8]) ve normal ERmorfolojisinin korunması [8] dahil olmak üzere ER ile ilgili çeşitli süreçlerde yer almaktadır. Bölüm 3.1.1'de açıklandığı gibi, Rab18'in ayrıca yakın zamanda kinektin{13}} [198] ile etkileşimi yoluyla anterograd ER tübül taşınmasını teşvik ettiği gösterilmiştir ve bu sonuçla uyumlu olarak, ağın dinamik tübüler bölgelerinin tükenmiş hücrelerde bulunmadığı görülmüştür. Rab18 [8].

Morfolojiyi düzenleyen proteinler, ERdinamik ve hastalık arasında benzer bir ilişki, spinoserebellar ataksi tip 2'de (SCA2) ataksin-2 ile gözlenir. Ataksin-2'deki mutasyonların SCA2'ye neden olduğu bilinmektedir [350]. Ataksin-2'in tükenmesi, ER ağındaki tabakaların oranını artırmanın yanı sıra hem boru şeklindeki hem de lümenal dinamikleri engellemiştir [28]. Tübüllerin tek yönlü, uzun mesafeli translokasyonu azaldı ve FRAP deneyleri, ataksin-2 yokluğunda lümenal bileşenlerin taşınmasının çok daha yavaş olduğunu gösterdi [28].

ER tübüllerinin uzatılmasında rol oynadığı bilinen proteinler olan Rab18 ve ataksin-2'deki mutasyonların her ikisi de tübüler morfolojide olduğu kadar dinamiklerde de kusurlara neden olur. Membranı şekillendiren proteinler ve ER-geç endozom/lizozom MCS'lerinde yer alan proteinlerin yanı sıra, başka bir protein daha vardır. hastalıkların olası nedeni ER ile mitokondri arasındaki yanlış iletişimdir. ER-mitokondri MCS, Ca2+ iyon transferinin önemli bölgeleridir [275]. Bozulmuş kalsiyum homeostazisi ilk olarak 1994 yılında Khachaturian tarafından nörodejeneratif hastalıkların olası bir nedeni olarak öne sürülmüştür [361].

O zamandan bu yana, ER-mitokondri MCS'yi düzenleyen birçok proteindeki mutasyonların insan hastalıklarında rol oynadığı gösterilmiştir. Parkinson hastalığında ER-mitokondriyal MCS'lerde görev alan veya bunların oluşumunda yer alan altı proteinde mutasyonlar bulunmuştur: Miro1 [318], Parkin [321], DJ-1 [323], -synuclein [325],PINK1 [327] ve LRRK2 [329]. Bu mutasyonların hepsinin organeller arasındaki kalsiyum iyon transferini değiştirdiği, ER-mitokondriyal MCS'yi bozduğu veya her ikisini birden yaptığı bulundu (bkz. Tablo 1). Miro1'in aynı zamanda mitokondriye kinesin{14}}'i de dahil ettiğini ve KIF5A mutasyonlarının mitokondriyal hareketliliği etkilediğinin gösterildiğini belirtmek önemlidir [362]. Alzheimer hastalığında presenilinlerdeki mutasyonlar aynı zamanda kalsiyum iyonu homeostazisini de bozar [335].

Ancak bu durumda düzensiz olan MCS'lerden ziyade ryanodin reseptörleri (RyR) ve inositol 1,4,5-trifosfat reseptörlerinin (IP3R) işleyişidir [333,334,363]. Charcot Marie Tooth (CMT) hastalığı aynı zamanda ER-mitokondri MCS oluşturan proteinlerdeki mutasyonlarla da ilişkilendirilmiştir [303,306], ancak CMT ile kalsiyum dinamikleri arasında herhangi bir bağlantı bulunamamıştır.

ER ve mitokondri arasındaki membran temas bölgelerinin düzensizliği diğer nörodejeneratif olmayan hastalıklarda da suçlanmıştır. Her ikisi de mitofusin 2 [308,309] ve VDAC-1/grp75/IP3R-1 Ca2+ transfer kompleksinde [310] mutasyon bulunan hücrelerde, diyabetin bir özelliği olan bozulmuş insülin sinyali gözlenir. bunlardan ER ve mitokondriyi MCS'lere bağlar.

Ek olarak, ER-mitokondri arayüzündeki birçok proteinin çeşitli kanserlerle ilişkilendirildiği görülmüştür ([345]'te incelenmiştir). Dinamine bağlı protein 1'deki mutasyonlara bağlı olarak ER-ER-mitokondriyal MCS'lerdeki anormal mitokondriyal fisyon da ensefalopatiye yol açar [340]. Ek olarak, ER-mitokondriyal MCS'ler, MCS'lerde Ca2+ homeostazisinde yer alan sigma-1 reseptöründeki [300] mutasyonlar yoluyla ALS ile ilişkilendirilmiştir. Bu MCS'ler, mutant hücrelerde bozulmuştur [302]. ALS mutasyonları aynı zamanda ER-mitokondriyal MCS'lerde değişen Ca2+ dinamikleriyle de ilişkilendirilmiştir. VAPB'nin ALS mutant formu, dış mitokondriyal membran proteini PTPIP51 ile değiştirilmiş bir MCS'ye yol açar ve bu MCS'lerde Ca2+ alımını bozar [296].

Diğer birçok ALS mutasyonu, VAPB'dekiler gibi ER-mitokondriyal temasları etkiler (bu sayıdaki Chen ve diğerleri ve Borgese ve diğerleri tarafından yapılan incelemelere bakınız [275,291]). Hücre içi kalsiyum homeostazisi aynı zamanda ER ile plazma zarı arasındaki MCS'leri de içerir. ER kalsiyum depolarının tükenmesi üzerine, hücre dışı Ca2+, plazma zarı boyunca SOCE yoluyla MCS'deki ER'ye aktarılır.

ER'de yerleşik protein STIM1 ve plazma zarında yerleşik protein Orai1, SOCE'yi kolaylaştıran bir kompleks oluşturur (bkz. Bölüm 2.2.4). Bu proteinlerin birindeki veya her ikisindeki mutasyonların, kalsiyum homeostazisinin düzensizliği yoluyla tübüler agregat miyopatisine (TAM) ve ilgili Stormorken sendromu durumuna neden olduğu bilinmektedir [311-315]. STIM1'in EB proteinlerine bağlanması TAC'leri oluşturduğundan, bu mutasyonların TAC bazlı ER tübül uzantısı üzerindeki etkilerini belirlemek ilginç olacaktır. Patojenik enfeksiyonlar aynı zamanda ER ile ilişkili proteinlerle de bağlantılıdır.

Patojenler, replikasyonlarını ilerletmek için konakçı hücredeki ER'yi ele geçirirler ([364,365]'te gözden geçirilmiştir). Bu patojenlerin birçoğu için, ER'de yerleşik proteinlere bağlanarak MCS'leri oluşturan proteinler keşfedilmiştir. Bu bölgeler patojen replikasyonu için çok önemlidir.

ER ile etkileştiği bilinen patojenler arasında Legionella pneumophila [352], Brome mozaik virüsü (BMV) [356], zarfsız polyomavirüs SV40 [206], enterovirüs 71 [357], Zika virüsü [358] gibi flavivirüsler ve Chlamydia trachomatis bulunmaktadır. Retikülonlar, Ceg9'un bağlanması yoluyla Legionella pneumophila tarafından, viral protein 1a [356] aracılığıyla BMV ve enterovirüs proteini 2C [357] yoluyla enterovirüs 71 tarafından hedeflenir.

Bu vakaların üçünde de patojen replikasyonu retikülonların bağlanmasıyla desteklenmektedir [351,356,357]. Legionella pneumophila aynı zamanda flavivirüs ailesi üyelerinin yaptığı gibi replikasyonu teşvik etmek için [351] atlastinlerle [352] etkileşime girer: Dang virüsü, Zika virüsü ve Batı Nil virüsü [358]. Chlamydia trachomatis proteinleri ER ile membran temas bölgeleri oluşturmak için VAPA, VAPB [353] ve CERT'e [354] bağlanır.

CERT veya VAP proteinlerinin tükenmesi bakteriyel replikasyonu azalttı [354], bu da ER-patojenMCS'lerin patojen replikasyonu için kritik olduğunu bir kez daha gösterdi. İlginç bir şekilde, ER membranını şekillendiren proteinlerin de viral replikasyonu baskıladığı bulunmuştur. Retikülon 3'ün hepatit C virüsünün yapısal olmayan proteini 4B'ye (NS4B) bağlandığı bulunmuştur [366]. NS4B'nin kendi kendine oligomerizasyonu viral replikasyonu kolaylaştırır [367].

Ancak retikülon 3 bağlandığında NS4B'nin kendi kendine oligomerizasyonu önlenir ve dolayısıyla viral replikasyon baskılanır [366]. SV40, büyük olasılıkla genişletilmiş bir perinükleer ERQC'de (Bölüm 2.2.1) ERAD makinesini [368] kullanarak ER membranından geçerek sitoplazmaya girer ve bunun, B14'e bağlanma yoluyla kinesin-1 fonksiyonunu içerdiği ileri sürülmüştür. ER-lokalize DNA-J alanı içeren membran proteini [206].

Özetle, tek proteinlerdeki mutasyonlar ER morfolojisi, dinamikleri ve MCS'ler üzerinde klinik patolojilere yol açan yıkıcı etkilere sahip olabilir. Çoğu durumda, morfoloji, dinamikler ve MCS'ler sıkı bir şekilde bağlantılıdır; bu üç özellikten birini etkileyen mutasyonlar sıklıkla diğerleri için zincirleme etkilere neden olur. Hastalığa neden olan mutasyonlar üzerine yapılan son araştırmalar, ER morfolojisini ve dinamiklerini bağımsız olarak incelemek yerine, ilgili konular olarak ele almaya başlıyor.

Bu alanda gelecekteki çalışmaların, morfoloji ve dinamikler arasındaki ilişkinin yanı sıra ER dinamiklerinin, morfolojiyi değiştirdiği bilinen hastalıklarla nasıl ilişkili olduğuna dair içgörü sağlaması muhtemeldir.

5. Tartışma

ER morfolojisini düzenlemekten sorumlu olan birçok protein tanımlanmış olup, morfoloji ile fonksiyon arasındaki bağlantılar artık netlik kazanmaktadır. ER dinamiklerini ölçmeye ve dinamiğin organel tarafından gerçekleştirilen süreçler üzerinde ne gibi etkileri olabileceğini anlamaya henüz yeni başlıyoruz.

Morfolojiyi düzenleyen proteinlerdeki mutasyonların birçok insan hastalığına neden olduğu bulunmuştur (Tablo 1) ve çoğu durumda ER'nin yapısı anormaldir; bu da ER'nin morfolojisinin, dinamiğinin ve fonksiyonunun doğası gereği bağlantılı olduğunu gösterir. ER dinamikleri, ER'nin ve onun birçok MCS'sinin organizasyonunun kurulması ve sürdürülmesinde de açıkça hayati öneme sahiptir. Yine, ilgili proteinler hastalıkta sıklıkla mutasyona uğrar. Gelecek için önemli bir zorluk, bu dinamiklerin oynadığı rolleri tanımlamak ve farklı hareketlilik türlerinin katkısını birbirinden ayırmaktır.

Oldukça hareketli ER tübülleri ve potansiyel olarak etkileşime giren organeller 5 µm/s'ye varan hızlarda hareket ettiğinden ve genellikle olduğu gibi her 1,5-5 saniyede bir kare görüntüleme sırasında güvenilir bir şekilde tespit edilemediğinden, bu, yaygın olarak kullanılan daha hızlı kare hızı görüntülemeyi gerektirecektir. kullanılmış (örneğin, [22,38,75,176,219]). ER dinamiklerini incelemek için başvurulacak hücre çizgisi olan Cos-7 hücresinin, diğer hücre çizgilerine göre çok daha az dinamik bir ER'ye sahip olduğunu belirtmek de önemlidir [20].

Sabit ve canlı hücrelerin süper çözünürlüklü mikroskopisinin ortaya çıkışı, ER yapısı ve dinamiklerine ilişkin yeni anlayış zenginliği sağlamaya devam edecektir. ER dinamiklerini analiz etmek ve ölçmek için çeşitli yöntemlerin yakın zamanda yayınlanmasıyla, düzensiz ER dinamikleri ile hastalık arasında daha fazla bağlantının keşfedilmesini bekliyoruz. Bu keşiflerin ER hareketinin işlevsel temelinin daha iyi anlaşılmasına yol açacağını umuyoruz. ER dinamiği araştırmalarının geleceği parlak görünüyor!
Yazar Katkıları: HTP ve VA taslağı yazdı. Tüm yazarlar yazının yayınlanmış versiyonunu okumuş ve kabul etmiştir.

Finansman: HTP, Mühendislik ve Fizik Araştırma Konseyi Ph.D. tarafından finanse edildi. DTP öğrenciliği, hibe numarası EP/N509565/1.

Kurumsal İnceleme Kurulu Beyanı: Geçerli değil.

Bilgilendirilmiş Onam Beyanı: Geçerli değil.

Veri Kullanılabilirliği Beyanı: Geçerli değil.

Teşekkür: Bu inceleme oldukça karmaşık bir konuyu kapsadığından, çalışmalarına yer veremediğimiz meslektaşlarımızdan özür dileriz.
Çıkar Çatışmaları: Yazarlar herhangi bir çıkar çatışması beyan etmemektedir. Finansörlerin taslağın yazılmasında veya sonuçların yayımlanması kararında hiçbir rolü yoktu.

Referanslar

1. Valm, AM; Cohen, S.; Legant, WR; Melunis, J.; Hershberg, ABD; Dur E.; Cohen, AR; Davidson, MA; Betzig, E.; Lippincott-Schwartz, J. Organel interaktomunu ortaya çıkarmak için sistem düzeyinde spektral görüntüleme ve analizin uygulanması. Nature 2017, 546, 162–167.[CrossRef] [PubMed]

2. Voeltz, GK; Prinz, WA; Shibata, Y.; Rist, JM; Rapoport, TA Tübüler endoplazmikretikulumu şekillendiren bir sınıf membran proteini. Hücre 2006, 124, 573–586. [ÇaprazRef]

3. Hu, J.; Shibata, Y.; Voss, C.; Şemeş, T.; Li, Z.; Coughlin, M.; Kozlov, MM; Rapoport, TA; Prinz, WA Endoplazmik retikulumun membran proteinleri, yüksek eğrilikli tübülleri indükler. Bilim 2008, 319, 1247–1250. [CrossRef] [PubMed]

4. Hu, J.; Shibata, Y.; Zhu, PP; Voss, C.; Rismanchi, N.; Prinz, WA; Rapoport, TA; Blackstone, C. Borulu ER Ağının Oluşturulmasında Yer Alan Bir Dinamin Benzeri GTPazlar Sınıfı. Hücre 2009, 138, 549–561. [ÇaprazRef]

5. Orso, G.; Pendin, D.; Liu, S.; Tosetto, J.; Moss, TJ; Faust, JE; Micaroni, M.; Yegorova, A.; Martinuzzi, A.; McNew, JA; ve ark. ER membranlarının homotipik füzyonu, dinamin benzeri GTPaz Atlastin'i gerektirir. Doğa 2009, 460, 978–983. [ÇaprazRef] 

6. Wang, S.; Tukachinsky, H.; Romano, FB; Rapoport, TA ER-şekillendirici proteinler atlastin, lunapark ve retikülonların işbirliğiyle boru şeklinde bir membran ağı oluşturulur. Elife 2016, 5, 1–29. [ÇaprazRef]

7. İngilizce, AR; Voeltz, GK Rab10 GTPase, ER dinamiklerini ve morfolojisini düzenler. Nat. Hücre Biol. 2013, 15, 169–178.[CrossRef] [PubMed]

8. Gerondopoulos, A.; Bastos, RN; Yoshimura, SI; Anderson, R.; Carpanini, S.; Aligianis, I.; Handley, MT; Normal ER yapısı için Barr, FA Rab18 ve aRab18 GEF kompleksi gereklidir. J. Hücre Biol. 2014, 205, 707–720. [ÇaprazRef]

9. Chen, S.; Novick, P.; Ferro-Novick, S. ER ağ oluşumu, dinamin benzeri GTPaz Sey1p ile Lunapark ailesi üyesi Lnp1p arasında bir denge gerektirir. Nat. Hücre Biol. 2012, 14, 707–716. [ÇaprazRef]

For more information:1950477648nn@gmail.com